Kaikki Myllymäen koulun oppilaat kuuluvat oppilaskuntaan. Jokainen luokka on äänestänyt oman edustajansa oppilaskunnan hallitukseen, jonka toimintaa ohjaavat opettajat Hanna Wejberg ja Sanni Xiong.

Sihteerin laatimat muistiot kokouksista tulevat näkyviin koulun kotisivuille. Oppilaskuntatoiminta antaa oppilaille mahdollisuuden vaikuttaa omalta osaltaan koulun toimintaan ja sen kehittämiseen.