Itämeri on pieni, suljettu ja suhteellisen matala merialue. Sen vesi on makean ja suolaisen veden sekoitusta, murtovettä. Itämeressä vesi on kerrostunut lämpötilan ja suolaisuuden mukaan.
Murtovedessä elää sekä suolaisen että makean veden lajeja. Lajimäärä on suhteellisen pieni ja ravintoketjut lyhyitä. Alhainen suolapitoisuus hidastaa monien merieliöiden kasvua. Tärkeimpiä tuottajia ovat planktonlevät ja syanobakteerit. Levien massaesiintymää kutsutaan leväkukinnaksi.
Rehevöityminen on Itämeren suurin ongelma. Se johtuu ihmisen aiheuttamasta, lisääntyneestä ravinnekuormituksesta. Kuormitusta aiheuttavat mm. Itämeren rantavaltioiden asutus, teollisuus, liikenne sekä maa- ja metsätalous. Suomessa suurin ravinnekuormituksen lähde on maatalous.
Itämeren muita uhkia ovat vieraslajit, ympäristömyrkyt, laivaliikenne, öljyvahingot, roskaantuminen ja ilmastonmuutos.
Itämeri on pieni, suljettu ja suhteellisen matala merialue. Sen vesi on makean ja suolaisen veden sekoitusta, murtovettä. Itämeressä vesi on kerrostunut lämpötilan ja suolaisuuden mukaan.