Kuoren väri

Omenan kuoressa on pohjaväri- ja peiteväri. Joidenkin lajikkeiden hedelmät ovat kypsänäkin yksivärisiä. Peiteväri voi olla pohjavärin päällä ohuina tai paksuina viiruina tai suurempialaisina värialueina.
Puun valoisan puolen oksissa omenien väri voi olla punaisempi kuin sen varjopuolella.

Joillakin omenalajikkeilla kuoren pinnalla on perusvärien lisäksi ruskeaa korkkiumaa (ns. korkkia). Sitä on useimmiten omenan kantakuopan ympärillä. Korkkiuman määrä ja sijainti on lajiketyypillinen ominaisuus.

Hedelmän muoto

Eri lajikkeilla on erimuotoiset hedelmät. Jotkin omenat ovat esimerkiksi kartiomaisia, toiset lajikkeet litteitä. Joillekin omenoille tyypillistä on hedelmien epäsymmetrisyys: toinen puoli hedelmästä roikkuu alempana kuin toinen. Omenan pinnan epämuotoisuutta voi lisätä omenan pinnan harjuisuus. Sen näkee parhaiten omenan poikkileikkauksesta.

Omenan kantakuoppa

Omena kiinnittyy oksaan kannastaan. Joillakin lajikkeilla on tyypillisesti pitkä kanta ja toisilla hyvin lyhyt. Kannan pituus ei sovellu kovin hyvin lajikkeen tunnistukseen.

Kantakuoppa voi olla matala tai syvä tai jotain siltä väliltä. Kantakuoppa voi olla muodoltaan leveä tai ahdas. Joillakin lajikkeilla kantakuoppa on täynnä hedelmän lihaa ja tilalla on kyhmy. Myös kantakuopan alueella tavattava ruskeanvärinen korkkiuma on lajiketyypillinen ominaisuus.

Omenan silmäkuoppa

Omenan silmäkuopan syvyys vaihtelee matalasta syvään, sen ympärillä voi olla nystyjä tai muita tuntomerkkejä. Joskus kuoppa on leveä, toisinaan hyvin syvä ja jyrkkäreunainen. Nämä ovat lajiketyypillisiä ominaisuuksia.

Silmäkuopan keskellä on näkyvissä viisi pientä verholehteä. Kun verholehtien kärjet ovat erillään toisistaan, silmä on avoin. Jos ne ovat kiinni toisissaan, silmä on kiinni.