Perustan kansallisen kasvigeenivaraohjelman toiminnalle laati maa- ja metsätalousministeriön asettama laaja asiantuntijatyöryhmä. Toiminnan keskeiset periaatteet ja tavoitteet määriteltiin seuraavasti (MMM:n julkaisuja 12/2001):

• Maa- ja metsätalouden kasvigeenivarat ovat maa-, puutarha- ja metsätalouden sekä näihin perustuvien elintarvikehuollon ja metsäteollisuuden perusta.

• Näitä geenivaroja suojellaan, ylläpidetään ja käytetään kestävästi, jotta varmistetaan perinnöllisen monimuotoisuuden säilyminen myös tulevaisuuden tarpeita varten.

• Kasvien perinnölliseen muunteluun perustuvalla ja sitä hyödyntävällä tutkimuksella ja kasvinjalostuksella tuotetaan oloihimme soveltuvia lajikkeita ja kantoja maa- ja metsätalouden tarpeisiin myös tulevaisuudessa.

• Kansainvälisillä sopimuksilla, pohjoismaisella geenipankki- ja geenivarayhteistyöllä sekä kansallisilla toimenpiteillä varmistetaan toisaalta maa- ja metsätalouden geenivarojen suojelu ja kestävä käyttö, toisaalta geenivarojen saatavuus kasvinjalostuksen ja tutkimuksen tarpeisiin.

• Kasvigeenivarojen suojeluun ja kestävään käyttöön liittyvien avoimien kysymysten ratkaiseminen edellyttää monialaista tutkimusta.

• Hallinnonalojen välisellä yhteistyöllä varmistetaan geenivarojen suojeluun ja kestävään käyttöön tähtäävien toimenpiteiden kattavuus, mukaan lukien opetus, neuvonta ja tiedotus.