Tutkittaessa raparperien erilaisuutta yleensä verrataan niiden lehtiruoteja. Lehtiruodin väri vaihtelee vihreästä punaiseen, samoin ruodin paksuus voi vaihdella. Raparperikantojen makuerot syntyvät eroista omena- ja oksaalihappopitoisuudessa, osa raparpereista on toisia vähähappoisempia.

Raparperien kasvurytmi voi olla erilainen. Lounaisrannikolta kerättyjen raparperien on havaittu olevan keväällä varhemmin kasvuun lähteviä verrattuna pohjoisesta kerättyihin kantoihin.

Samalla tavalla kuin lehtiruodeissa, myös kukinnoissa, kukinnon runsaudessa, lehtilavassa ja juurakossa on perinnöllisiä eroavaisuuksia.