Lyseo tarjoaa musiikista kiinnostuneille opiskelijoille hienoja mahdollisuuksia. Musiikkiluokan soittimisto on korkeatasoinen ja tilat antavat mahdollisuuden monenlaisten musiikkiprojektien toteuttamiselle. Lyseon kuoro on musiikkituntien rinnalla lukion musiikkikulttuurin kivijalka. Kuoro on avoin kaikille opiskelijoille ja välillä laulamaan tulevat nekin, jotka ovat jo Lyseosta valmistuneet. Neljän valtakunnallisen opintojakson lisäksi tarjolla on viisi paikallista opintojaksoa sekä musiikin lukiodiplomi. Musiikin opintojaksoilla opiskelijat pääsevät laulamaan ja soittamaan bändeissä, tutustuvat maailmanmusiikkiin, tutkivat taidelajien keskinäistä yhteyttä ja tutustuvat Kotkan kulttuurielämään.

Lyseon juhlasalin akustiikka on erinomainen musiikin esittämiseen. Salin Steinway & Sons-flyygeli on korkeatasoinen konserttiflyygeli ja soittotaitoisten opiskelijoiden käytettävissä välituntisin ja hyppytunneilla. Musiikkiluokassa saa musisoida muulloinkin kuin oppitunneilla, ja Lyseossa kannustetaankin opiskelijoita perustamaan omia yhtyeitä.

Lukiolainen voi sisällyttää musiikkiopiston kursseja lukio-opintoihinsa. Koulupäivän ajaksi isommallekin instrumentille löytyy turvallinen säilytystila. Lyseosta on maailmalle lähtenyt useita musiikin osaajia, esimerkiksi Essi Höglund, jonka jatko-opintoihin musiikin parissa voi kurkistaa tästä youtube-linkistä.

Kymi Sinfonietta on monivuotinen yhteistyökumppani musiikin opetuksessa. Opiskelijat pääsevät kuuntelemaan orkesterikonsertteja ja tutustumaan ammattimuusikon työhön erilaisten vierailujen kautta.