Varkauden vesistöt kuuluvat Saimaaseen.
Vesistöjä ovat:
Joutenlahti,Komminselkä,Haijanselkä,Kinkamonselkä,Timonselkä,
Vuoriselkä,Mula,Immolanjärvi,Rauhajärvi,Sorsajärvi,Homeselkä,
Heposelkä ja Kilpijärvi.