Kun oppilas tarvitsee kokonaisvaltaisempaa, suunnitelmallisempaa ja vahvempaa tukea oppimiseensa tai koulunkäyntiinsä, siirrytään erityiseen tukeen. Tällöin eri oppiaineissa oppimääriä on mahdollista helpottaa ja suunnitella oppilaalle yksilölliset tavoitteet oppimiseen. Oppilas etenee opiskelussa henkilökohtaisten tavoitteidensa mukaan.
Ennen tuen aloittamista oppilaan oppimisen tilanteesta tehdäänpedagoginen selvityshuoltajaa ja oppilasta kuullen. Tämän jälkeen rehtori tekee erityisen tuen päätöksen, mikä on virallinen hallintopäätös valitusosoituksineen.
Erityisessä tuessaoppilaalle laaditaanyhteistyössä opettajien, oppilaan ja huoltajien kesken henkilökohtainen opetuksen järjestämistä koskeva suunnitelma eliHOJKS, johon annettava tuki kirjataan. HOJKS kirjataan Wilmaan.