Todellisissa tapauksissa toiset geenit vaikuttavat usein geenien ilmentymiseen. Esimerkiksi eräässä hiirikannassa turkin väriin vaikuttaa kaksi geeniä. Toisen geenin dominoiva alleeli saa aikaan mustan värin (R) ja resessiivinen alleeli ruskean värin (r). Toinen geeni vaikuttaa siihen, ilmeneekö väri turkissa. Dominoiva alleeli (V) saa värin ilmenemään turkissa. Jos yksilöllä on kaksi tämän geenin resessiivistä alleelia (vv), väri ei ilmene turkissa, vaan hiiret ovat valkoisia.

Kun risteytetään molempien geenien suhteen heterotsygoottiset yksilöt, saadaan kolmenlaisia jälkeläisiä lukusuhteessa 9:3:4 (mustat:ruskeat:valkoiset).

P-polvi: RrVv ja RrVv

Sukusolut: RV, Rv, rV ja rv

F₂-polvi:

Ilmiötä, jossa toisen geenin ilmentyminen peittää alleen toisen geenin vaikutuksen, kutsutaan epistasiaksi. Tässä esimerkissä värin ilmenemiseen vaikuttava geeni peitti alleen mustan tai ruskean värin aikaansaavan geenin vaikutuksen. Tämän voi ymmärtää helposti, jos muistaa, miten geenit tuottavat tiettyä proteiinia. Esimerkissä geeni R tuottaa tietynväristä pigmenttiä tuottavaa proteiinia. Vastaavasti geeni V tuottaa proteiinia, joka siirtää tuotetun värin turkkiin. Jos tämä geeni on viallinen (resessiivinen alleeli), väri ei päädy turkkiin ja turkista tulee valkoinen. Geeni V:n vaikutus siis peittää osittain alleen geeni R:n vaikutuksen, sillä ne tuottavat eri proteiineja, jotka molemmat vaikuttavat turkin väriin.