Vesihometartunnat Suomen kalanviljelylaitoksissa

Johdanto

Vesihomeprojekti
Ruokaviraston, Jyväskylän Yliopiston ja Åbo Akademin projektissa tutkittiin bakteerien merkitystä vesihomeen esiintymisessä ja vesihomeen sekä bakteerien PCR tunnistusmenetelmiä.

Mitä on vesihome?
Vesihome on ”sieni”(tyyppinen) tartunta kalojen ihossa. Erilaiset ”sieni”lajit voivat aiheuttaa samantyyppiset oireet kalojen ihossa:

• Achlya
• Aphanomyces
• Leptolegnia
• Pythium
• Phoma
• Phusarium
Saprolegnia

Usein rihmamaista kasvustoa kalan ihossa, evissä, ja kiduksissa. Kaikki ”sieni”lajit lisääntyvät ja leviävät itiöiden avulla (myös seksuaalinen lisääntyminen).

Kuvia vesihomeinfektioista kaloilla:





Mitä on Saprolegnia?
Kyseessä on leväsieni (oomycetes). Saprolegniaa on monta eri lajia, noin 30 - 35 lajia. Noin 6-8 lajia aiheuttaa kaloissa infektion:

• Saprolegnia parasitica
• Saprolegnia diclina
• Saprolegnia ferax
• Saprolegnia australis
• Saprolegnia hypogyna
• Saprolegnia torulosa
• Saprolegnia salmonis (parasitica)

Kuvia Saprolegniasta:







Vesihomeprojektin tavoitteet, Åbo Akademi
Vesihometyyppiset oireet lisääntyneet kaloissa viime vuosina, sekä Suomessa että monessa muissa maissa.
Mikä on vesihometartunnan taudinaiheuttaja tai aiheuttajat
? Onko eri kalalajeissa, mädissä ja ruskuaispussipoikasissa eri aiheuttajia/kantoja?

Projektissa tutkittiin eri kalalajeja ja kalan kehitysvaiheita:

Kalalajit:
- Kirjolohi, 12 näytettä
- Siika, 8 näytettä
- Lohi, + järvilohi, 5 näytettä
- Taimen, meri- ja järvi-, 8 näytettä
- Nieriä, 1 näyte

Mäti:
- Kirjolohi, 2 näytettä

Ruskuaispussipoikaset:
- Kirjolohi, 2 näytettä

Näytteitä kerättiin eri maanosista:
- Pohjois-Suomi (PS), 8 laitosta
- Itä-Suomi (IS), 9 laitosta

- Länsi-Suomi (LS), 2 laitosta

- Etelä-Suomi (ES), 1 laitos



Kirjolohen ruskuaispussipoikanen

Miten vesihome eristettiin?
Kaloista (mäti) otettiin näyte, joka viljeltiin agarlevyllä --> muodostui valkoinen rihmakasvu. Rihmat viljeltiin vedessä, missä muodostui itiöitä.
 
Yhdestä (!) itiöstä eristettiin puhdas vesihomekanta. Kannoista eristettiin DNA, josta analysoitiin 6 geeniä. DNA (geenisekvenssit) käytettiin kantojen tunnistamiseen ja eri Saprolegnia parasitica- kantojen määrittämiseen.







Kuvat: Lotta Landor

Tulokset
Yhteensä 163 vesihomekantaa, näistä 137 analysoitiin geneettisesti (6 geeniä). DNA tulokset osoittivat, että
  • 90 % tutkituista kannoista oli Saprolegnia spp
  • 72% tutkituista kannoista oli Saprolegnia parasitica



Kalat
Noin 85 % kaikista tutkituista, kaloista eristetyistä kannoista oli Saprolegnia parasitica. Muut kannat olivat:

  • Saprolegnia australis (1)
  • S. torulosa (1)
  • S. diclina (2)
  • Saprolegnia sp. (3)
  • Phoma (4)
  • Sieni (5)



Mäti ja ruskuaispussipoikaset
Mädistä (2 laitosta) eristettiin eniten Saprolegnia diclina, mutta myös muita Saprolegnia -lajeja, sekä sienet/leväsienet. Muutama S. diclina- kanta löydettiin myös kaloista (kirjolohi, järvitaimen). Ruskuaispussipoikasista (1 laitos) Saprolegnia parasitica, S. ferax, Saprolegnia sp. sekä sieni (Leptolegnia).




Saprolegnia parasitica
Löytyykö erilaisia geneettisiä kantoja ja onko dominoivia kantoja:

  • Yksi dominoiva kantakomplexi/kloonikomplexi
  • S. parasitica kannat ruskuaispussipoikasista muodostavat erillisen ryhmän (kantakomplexi/kloonikomplexi)


Jokainen pallo” (ST, Sequence Type) on erillinen genotyyppi. Pallojen volyymi on suhteessa kantojen määrään. Viiva genotyyppien välillä tarkoittaa että genotyypit ovat lähisukuisia” (yksi poikkeama tutkitussa genomissa).

Saprolegnia parasitica, Kalaisännät
Ei todettu selvää isäntäjakaumaa, mutta
  • ST2 & 4, dominoi siiassa (whitefish) ja lohessa (salmon)
  • ST1 & 3, dominoi kirjolohessa (rainbow trout) ja järvitaimenessa (lake trout)



Saprolegnia parasitica
, Maantieteellinen jakauma
Näytteet jaettu 4 (5) eri ryhmään riippuen mistä ne tulevat. Näytteiden selvää maantieteellistä jakaumaa ei todettu.

  • ST1 & 3, dominoi Itä-Suomessa
  • ST2 & 4, dominoi Pohjois-Suomessa



Johtopäätökset
Saprolegnia parasitica -kannat, jotka kuuluvat yhteen ja samaan kloonikomplexiin aiheuttavat suurimman osan vesihometartunnoista Suomen kalanviljelylaitoksissa; tämä kloonikomplexi voidaan jakaa neljään ala-kloonikomplexiin.

Tulokset viittaavat siihen, että tietyt kalalajit ovat infektoituneet tietyllä Saprolegnia parasitica ala-kloonikomplexilla
. Myös vesihometautisista ruskuaispussipoikasista löytyi Saprolegnia parasitica tartuntaa, muttä nämä kannat olivat erilaisia, verrattuna kaloista eristettyihin kantoihin (kuitenkin näytteiden lukumäärä aika pieni).

Kirjolohen mädistä olevasta vesihometartunnasta löydettiin erilaiset Saprolegnia -lajit, Saprolegnia diclina + hypogyna, mutta ei Saprolegnia parasiticaa, eli Saprolegnia ilmeisesti ei siirry mädistä kaloihin.


Lähde ja lisää aiheesta:
Vesihometartunnat Suomen kalanviljelylaitoksissa.pdf