Herajoen koulussa varataan lukuvuotta kohden yhden tai kahden työviikon oppitunteja vastaava aika monialaisten oppimiskokonaisuuksien eli ilmiöviikkojen järjestämiseen. Viikkojen ajankohdat ja järjestämistavat vaihtelevat vuosittain aihepiirin tavoitteiden ja sisältöjen mukaan.

Viikon ohjelma suunnitellaan aina erikseen eikä silloin seurata oppiainelukujärjestystä. Oppilaiden viikkotuntimäärä on Herajoen koulun tuntijaon mukainen ja opettajat työskentelevät viikon aikana oman viikkotuntimääränsä verran.

Ilmiöviikkojen suunnittelussa otetaan huomioon mm. seuraavia asioita:
- valinnaisuus
- oppilaslähtöisyys
- luokkarajojen rikkominen
- yhteistoiminta
- toiminta ja tekeminen
- monipuolinen arviointi