Koulujen toimintakulttuurin näkökulmasta Muuramessa painottuvat hyvinvointitaidot, joita harjoitellaan keskeisesti hyvinvoinnin vuosikellon avulla.

Oppimisen edellytyksiä tukevien opetusjärjestelyjen osalta rehtorin vastuualueeseen kuuluu pedagogisesti toimivien opetustilojen järjestäminen yhteistyössä teknisen toimen kanssa. Kokonaisuuteen kuuluu luokkatilojen lisäksi esimerkiksi eriyttämisen tilat ja kalustus. Rehtori vastaa myös opetusryhmien muodostamisesta, työjärjestyksistä, oppilaaksiotosta, pienryhmäpäätöksistä, uusien oppilaiden sijoittelusta ja henkilökunnan osaamisen tukemisesta. Tarvittaessa rehtori tekee opetusjärjestelyjä koskevien päätösten tueksi monialaista yhteistyötä eri tahojen kanssa. Koulunkäynninohjaajien resursoinnista ja muusta ohjauksesta vastaa opetuksen tuen päällikkö. 

Rehtori on pääasiallisessa vastuussa myös koulun lukuvuosisuunnitelman laatimisesta. Suunnittelu tehdään soveltuvin osin yhteistyössä koulun johtoryhmän kanssa kevään, kesän ja alkusyksyn aikana. Alkusyksystä tehdään myös tarvittavat tarkennukset yhdessä opettajakunnan kanssa. Lukuvuosisuunnitelma käydään läpi rehtorikokouksessa, minkä jälkeen sivistysjohtaja vie ne hyvinvoinnin ja palvelujen lautakuntaan hyväksyttäväksi syys-lokakuun aikana.

Pienryhmien muodostamisen tavoitteena on, että ne rakentuvat joustavasti ja oppilaiden tuen tarpeiden mukaisesti. Muodostamisessa huomioidaan kunkin oppilaan oppimisen edellytykset ja toimintakyky. Palvelurakennetta tarkastellaan ja kehitetään lukuvuosittain. Varhaisen vaiheen konsultaatio pienryhmätarpeista sijoittuu nivelvaiheisiin eli siirryttäessä esiopetuksesta alakouluun siirryttäessä ja alakoulusta yläkouluun. Oppilaskohtaiset päätökset tehdään joka kevät. Pienryhmien koko määräytyy perusopetuslaissa määriteltyjen mitoitusten mukaisesti, poikkeuksena esimerkiksi kesken lukukauden ryhmään siirtyvät oppilaat, joiden kohdalla mitoitukset voivat väliaikaisesti ylittyä.