Joskus alleeleja voi olla enemmän kuin kaksi eri muotoa. Tällaisia alleeleja kutsutaan multippeleiksi alleeleiksi. Esimerkiksi ABO-veriryhmää koodaavasta geenistä on itse asiassa olemassa kolme eri muotoa: kaksi dominoivaa (I^A ja I^B) sekä yksi resessiivinen (i) muoto. Veriryhmät periytyvät kolmen alleelin säätelemänä, joista yhdellä yksilöllä voi olla perimässään vain kaksi.

Jos yksilö on homotsygoottinen resessiivisen alleelin suhteen (ii), hänellä on O-veriryhmä. Yksikin dominoiva alleeli saa aikaan joko A- tai B-veriryhmän. Alla on lueteltu kaikki mahdolliset genotyypit sekä niiden tuottama fenotyyppi (veriryhmä).