Sammakoiden kutupaikoiksi kelpaavia pikkulammikoita, tulvaojia ja lätäkköjä on Hyypässä runsaasti. Joen mutkittelun seurauksena syntyneet juoluat ovat hyviä kutupaikkoja. Kauhajärveltä on löytynyt jopa harvinaisen viitasammakon ja rupikonnan kutupaikkoja. Vesiliskoja on ainakin Kauhajärvellä, sisiliskot viihtyvät jopa lähellä asutusta. Vaskitsoista ja kyistä on vain vähän havaintoja.



Hyypänjoen rannoilla kasvavat pajut antavat hyönteisille suojaa, mikä puolestaan merkitsee runsasta ravintoa kaloille. Hyypänjoessa ja luomissa esiintyy purotaimenta, harjusta, haukea, ahventa, madetta, kivisimppua, kivinuoliaista ja pikkunahkiaista. Haukien kalastaminen joesta tukee taimenkannan lisääntymistä, koska hauet syövät taimenen poikasia. Hyypänjokeen ja Rauhaluomaan on istutettu taimenta luonnon oman kannan lisäksi. Joessa on vähän myös särkeä ja kiiskeä. Kauhajärvi on varsin matala ja siksi osittain umpeenkasvanut. Kauhajärvellä on haukea, ruutanaa ja ahventa sekä vähäisessä määrin lahnaa.