Hyypänjokilaaksossa on sekä kulttuurimaisemaan että metsäluontoon kuuluvia lajeja. Peltojen ja joen lisäksi alueella on paljon metsäsaarekkeita, puroja ja Kauhajärvi, mikä luo elinympäristöjä monille lajeille. Myös korkeuserot vaikuttavat kasvillisuuteen. Kaikki Hyypässä esiintyvät kasvi-, lintu-, hyönteis-, eläin- ja kalalajit on kartoitettu vuonna 1999 Valtakunnallisesti arvokkaan Hyypänjokilaakson kulttuurimaisema-alueen luontokartoitus -luontoselvityksessä (Seppälä & Yli-Teevahainen). Viereisessä kuvassa Kauhajärven kelluvia rahkasaaria.