Vedessä elää runsaasti eläimiä, joista suurin osa on selkärangattomia, kuten äyriäisiä, nilviäisiä, matoja ja hyönteisiä. Hyönteiset viettävät yleensä toukkavaiheensa vedessä, mutta osa elää siellä myös aikuisena. Lisäksi esiintyy hämähäkkieläimiä, kuten vesipunkki ja vesihämähäkki.
Osa pikkueläimistä, kuten vesimittarit ja hopeasepät, liikkuu veden pinnalla. Suurin osa selkärangattomista elää levien ja vesikasvien suojissa pinnan alla, ja pohjalla tavataan esimerkiksi simpukoita.