Perustoiminnot - Sidoskulmat ja sidospituudet
MarvinSpace kääntää 3D-malliin kaikki pöydälle olevat molekyylit. Kannattaa hakea mielekäs asetelma, jos halutaan verrata eri molekyylejä 3D-ympäristössä. Siirtäminen ja erikseen pyörittäminen ei onnistu MarvinSpace-ympäristössä eli uuden asetelman rakentaminen on helppoa tehdä palaamalla 2D-ympäristöstään ja järjestää molekyylit siellä.
Seuraavassa muutamia esimerkkejä ja MarvinSpace-ohjelman mahdollistamat lisätoiminnot (sidoskulmat, sidospituudet ja elektronitiheyskuvat).
|
Jos siirryttyä 3D-malliin vedyt eivät näy, vaakavalikosta haetaan kohta (vaalean vihreä pallo ja pieni harmaa pallo), jolla ne saadaan näkyviin. Jos valikko ei tule näkyviin. se on jäänyt mustan alueen taakse. Tällöin sulje ikkuna ja avaa uudelleen MarvinSpace, vältä mustan alueen klikkaamista. |
 |
| MarvinSpace -ohjelmassa voi pyörittää molekyylejä. Animation-valinta mahdollistaa myös automaattisen rotaation (Auto Rotation). |  |
Seuraavassa muutamia esimerkkejä ja MarvinSpace-ohjelman mahdollistamat lisätoiminnot (sidoskulmat, sidospituudet ja elektronitiheyskuvat).
|
Sidoskulman saa näkyviin valitsemalla toisen painikkeen (toinen vasemmalta) ja klikkaamalla kolme vierekkäistä atomia. Sidoskulmat ovat laskennallisia, eivät todellisia. Sidoskulmiin vaikuttaa sidoksen atomien muu ympäristö, sen vuoksi sidoskulmat eivät noudata esim. VSEPR-teorian mukaisia sidoskulmia. |
 |
| Vastaavasti sidospituuden saadaan ensimmäisestä painikkeesta. Sidospituuden on merkitty vanhalla yksiköllä eli Ångströmillä (10−10 m eli 0,1 nm eli 100 pm). Yksikkö on nimetty ruotsalaisen fyysikon Anders Jonas Ångströmin mukaan |  |