Ohjelma on mahdollista rakentaa monenlaisia yhdisteitä, joista tässä on esitelty lukio-opetuksessa eteen tulevista polymeerit ja orgaaniset suolat. Toisessa (polymeerit) käytetään erityistoimintoja, joilla saadaan polymeerille ominaiset elementit (toistuvat rakenneosat) näkyviin ja toisessa (orgaaniset suolat) taas käytetään valmista arkistoa rakenteiden tekemisessä (Templates).