Lukuvuonna 2026-2027 koululla järjestettävä kerhotoiminta on vilkasta. Kerhoja järjestetään sekä Harrastamisen Suomen mallin rahoituksella ("Merijärvi harrastaa") että Koulujen kerhotoiminnan avustuksella. Kerhotoiminnan suunnittelun pohjana on ollut oppilaille keväällä 2026 tehty kysely harrastustoiveista.

Harrastamisen Suomen mallin kerhoja koordinoi 4H. Koulun kerhotoiminnan koordinaattorina toimii opettaja Sanna Pikkarainen.