Paloahon koulussa kaikki muut oppilaat opiskelevat toiminta-alueittain, paitsi paljon tukea tarvitsevat valmistavan opetuksen oppilaat, jotka opiskelevat valmistavan opetuksen opetussuunnitelman mukaan. Toi-opetukselle on luonteenomaista oppimisen eheyttäminen / kokonaisopetus. Opetusta ei voi järjestää keskittyen vain yhteen toiminta-alueeseen kerrallaan. Esimerkiksi liikuntatunnilla opetellaan ja opitaan motoristen taitojen lisäksi sosiaalisia taitoja (esim. kuinka toimin muiden pelaajien kanssa), kommunikaatiotaitoja (esim. ohjeen ymmärtämistä, ”haluan valita…”), tiedollisia taitoja (esim. ongelmanratkaisutaitoja), ulkoliikuntaan liittyy pukeutumisen taidot päivittäisistä toimista ja niin edelleen.

Paloahon koulussa toteutetaan lukuvuosittain kaksi monialaista oppimiskokonaisuutta. Toinen näistä kokonaisuuksista on Kuopion perusopetuksen yhteinen aihekokonaisuus ja toinen koulun oma-aiheinen kokonaisuus. Usein aiheet sivuavat toisiaan. Kumpikin kokonaisuus on viikon mittainen. Tarkempi kuvaus ja aihealueet sekä viikkojen ajankohdat löytyvät lukuvuosisuunnitelmasta.