Jos kokelaalla on vamma, taikka luku- tai kirjoitushäiriö, hänen kokeensa voidaan järjestää poikkeavasti. Sama koskee kokelasta, joka on sairauden tai siihen rinnastettavan syyn vuoksi estynyt suorittamasta kokeita samalla tavalla kuin muut kokelaat. Myös vieraskielisten on mahdollista hakea erityisjärjestelyjä (lisäaika). Yleisin erityisjärjestely on lisäaika.

Ylioppilaskokeisiin anotaan samoja erityisjärjestelyjä, joita opiskelijan tueksi on käytetty lukio-opinnoissa. Ohjeet ja tarvittavat lomakkeet löytyvät ylioppilastutkintolautakunnan sivuilta. Opinto-ohjaajat ja erityisopettaja auttavat lomakkeiden täyttämisessä.

Lukio toimittaa erityisjärjestelyhakemukset ylioppilastutkintolautakuntaan ennen kuin kokelas ensimmäisen kerran ilmoittautuu tutkintoon. Kevään tutkinnon osalta erityisjärjestelyhakemus liitteineen on toimitettava lautakuntaan viimeistään 30.11. ja syksyn tutkinnon osalta viimeistään 30.4.

Lomakkeet lähetetään digitaalisesti ylioppilastutkintolautakunnan järjestelmässä. Koska lomakkeissa edellytetään tietoja, jotka koskevat opiskelijan opintoja koko lukioajalta, tulee lomakkeiden täyttäminen käynnistää jo hyvissä ajoin. Opiskelija saa ohjeet opinto-ohjaajalta tai erityisopettajalta.

Kokelas saa päätöksen hänelle myönnetyistä erityisjärjestelyistä kirjeitse kotiinsa hyvissä ajoin ennen kokeiden alkamista.