Luontokoulutoiminta alkoi Jyväskylän maalaiskunnassa reilut kaksi vuosikymmentä sitten, vuonna 1999, kun Palokan yläkoululle kokoontui asiasta kiinnostuneita ja innostuneita kouluväen ja Keski-Suomen ympäristökeskuksen ihmisiä. Luontokoulutoimintaa maalaiskunnassa on käytännössä ollut jo lähes koko peruskoulun ajan, mutta oman luontokoulun perustaminen ja virallistaminen luontokouluksi antoi asiaan uutta puhtia.

Toiminta vakiintui nopeasti maalaiskunnan sivistystoimen johdon ja sivistyslautakunnan ansiokkaalla myötävaikutuksella. Luontokoulu oli maalaiskunnassa tärkeä ja tunnustettu osa kuntamme koululaitoksen toimintaa ja noudatettava opetussuunnitelma oli kytkeytynyt kunnan omaan opetussuunnitelmaan.

Luontokoulumme on ollut esimerkkinä muille luontokouluille, koska opetus saavuttaa kaikki kuntamme oppilaat useita kertoja kouluvuosien aikana. Esimerkkinä kaikki ekaluokat ovat kummiluokkina ja kaikki kuudesluokkalaiset saavat melontakoulutuksen.
Oppilaita opastetaan liikkumaan luonnossa, tuntemaan kasveja ja eläimiä, kerättäviä sieniä ja marjoja. He oppivat samalla luonnossa selviytymistä ja sosiaalisia taitoja, ottamaan huomioon myös toiset, kantamaan vastuunsa ja huolehtimaan omasta ympäristöstään.

Jyväskylän maalaiskunnan ja Korpilahden yhdistyessä Jyväskylän kaupunkiin vuoden 2009 alusta; Jyväskylän maalaiskunnan luontokoulu muutti nimensä uuden kaupungin myötä Jyväskylän luontokouluksi.

Joulukuun 13. armon vuonna 2023 Jyväskylän sivistyslautakunta päättää kokouksessaan äänestyksen (10 ääntä lakkautuksen puolesta - 4 ääntä lakkauttamista vastaan) jälkeen lakkauttaa Jyväskylän luontokoulun osana Jyväskylän kaupungin talouden sopeuttamistoimia!

Vuoden 2024 kevätlukukauden aikana Jyväskylän luontokoulun yli 20-vuotinen toiminta ajetaan alas. Ohjelmat, välineistö ja henkilöstö inventoidaan ja sijoitetaan uudelleen.