Hydrofobiset molekyylit muodostavat sidoksia mieluummin keskenään kun veden kanssa. Tällöin hydrofobiset molekyylit pakkautuvat yhteen, jotta ne minimoisivat kosketuksen veden kanssa. Esimerkiksi solukalvon rasvahappoketjut pakkautuvat yhteen hydrofobisen vuorovaikutuksen vuoksi.