Pyhäjoki menee Haapaveden halki. Haapavedellä on myös järviä kuten Ainali, Haapajärvi, Osmanki, Pirnesjärvi, Apaja, Liitukka, Iso-Vatjusjärvi, Iso-Rytkynjärvi, Pieni-Rytkynjärvi, Korkattijärvi. Lampia ovat Haralampi, Kypärä, Mieluslampi, Haapolampi, Kypärä ja Ängleslampi