Molekyylien ja kiderakenteiden mallintaminen on yksi nykyaikaisen kemian opetuksen lähtökohdista. Submikroskooppisen tason mukainen opetus tukeutuu molekyylien piirtämiseen ja esittämiseen perustuviin ohjelmiin. 

Molview.org -palvelu molekyylien ja kiderakenteiden opetuksessa ei vaadi pitkää oppimisprosessia, vaan jo lyhyenkin opastauksen jälkeen oppija kykynee tuottamaan omia molekyylejä. 

Lukion kemiassa (on osa Abitti-järjestelmää ja YTL:n sähköistä koejärjerstelmää) MarvinSketch-ohjelmaa toimii niin orgaanisten molekyylien piirtämisessä kuin erilaisten rekatioiden ja reaktiomekanismien piirtämisessä. MarvinSketch-ohjelman käyttöä varten on ilmestynyt oma oppikirjansa: Orbitaali - MarvinSketch – Tervetuloa MarvinSketch -o. pintoihin (peda.net)