8.1. Molekyylin liukoisuus (logP)

Jakaantumiskerroin logP

Molekyylin liukoisuutta voidaan tutkia jakaantumiskertoimen avulla. MarvinSketch antaa kyseisen arvon valinnalla: Calvulations | Partitioning | logP . Display Options -välilehdestä valitaan Type-kohdasta molemmat ja valitaan kohta Display in MarvinSpace (ominaisuus löytyy myös uusimmista MarvinSketch -ohjelmaversioista). Kuva 1: MarvinSketch-ohjelman valinnat.

Jakaantumiskerroin
(P) kuvaa kemiassa ja farmasiassa aineen (kemiallisen yhdisteen, esimerkiksi lääkeaineen) jakaantumista kahden kosketuksissa olevan ja toisiinsa sekoittumattoman nesteen (yleensä vesifaasin ja orgaanisen faasin) välillä. Jakaantumiskerroin kuvaa aineen liukoisuutta ja affiniteettia kumpaankin liuottimeen.

Jakaantumiskerroin lasketaan aineen konsentraatioiden suhteesta kumpaankin liuottimeen. Mitä suurempi on jakaantumiskerroin, sitä rasvaliukoisempi aine on.

Orgaanisena faasina käytetään yleensä oktanolia. Tällöin jakaantumiskertoimesta käytetään nimitystä oktanoli/vesi-jakaantumiskerroin (Pow). Jakautumiskertoimen arvo ilmoitetaan usein logaritmiarvona (logP), koska jakaantumiskertoimen vaihteluväli on suuri eri yhdisteillä (P = 0,0001 – 100 000). logP-arvo kuvaa aineen rasvaliukoisuutta eli lipofiilisyyttä.

Kuva 2: MarvinSketch ja logP-arvo. Kuvassa tuotettu molekyylin rakenteen vaikutus rasvaliukoisuuteen.


Tässä kaksi poimintaa:
Molekyylit: etaani, eteeni, etanoli, etanaali ja etaanihappo Molekyylit: metyylipropaani, 2-buteeni, 2-butanoli, butenaali, butaanihappo
Tässä kannattaa huomata elektronitiheyttä kuvaavat 3D-kuvat. Vaikka MarvinSpace-ohjelma on uusista MarvinSketch-ohjelman versioista poistunut, sen ominaisuuksia on kuitenkin löydettävissä näistä erityistoiminnoista. Eri logP-arvojen vertailu ei ole lukion oppimäärän mukaista, joskin auttaa osaltaan ymmärtämään liukoisuutta ja niin myös eri molekyylien poolisuutta.

Peda.net käyttää vain välttämättömiä evästeitä istunnon ylläpitämiseen ja anonyymiin tekniseen tilastointiin. Peda.net ei koskaan käytä evästeitä markkinointiin tai kerää yksilöityjä tilastoja. Lisää tietoa evästeistä