Oppilaskunnan muodostavat koulun oppilaat, ja oppilaskuntaa edustaa oppilaskunnan hallitus, johon valitaan edustajat yläkoulun jokaiselta luokka-asteelta. Oppilaskunnan hallitus on oppilaiden keino järjestäytyä, tulla kuulluksi sekä osallistua ja vaikuttaa päätöksentekoon.
Jokivarren koulussa alaluokkien (1.-6 lk.) oppilaita edustavat miniministerit, yläluokkien (7-9. lk) oppilaita oppilaskunnan hallitus.
Lukuvuonna 2025-2026 alakoulun miniministereiden ohjaavina opettajina toimivat Kaisa Pelkonen ja Katariina Jansson, yläkoulun oppilaskunnan ohjaavana opettaja toimii Juhani Itäpää.

Oppilaskunta on ollut mukana järjestämässä koulumme viihtyvyyttä ja yhteisöllisyyttä lisääviä tapahtumia. 

Lukuvuonna 2025-2026 oppilaskunnan hallituksessa oppilaiden edustajina toimivat:

7A: Niilo Simola, Jaakko Verho

7B: Amanda Närhi, Amanda Pohja

7C: Kiia Lindroos, Sara Saarikoski

8. luokka: Leo Louhiniitty, Paavo Hiekka, Siiri Eerola, Annika Peltonen

9. luokka: Jaro Salo, Valtteri Nevalainen, Minttu Jaronen

Puheenjohtaja: Valtteri Nevalainen

Sihteeri (varapuheenjohtaja): Jaro Salo

Rahastonhoitaja: Minttu Jaronen