MarvinSketch -kurssi
PIIRTÄMINEN YMS
Edit -> preferences -> structure
general settings
- show lone pair as Line = VIIVANA ruksi tähän, PISTEINÄ ei ruksia tähän
carbon labels
- always = KUN PIIRRETÄÄN TÄYDELLINEN RAKENNE KAAVA
- never = KUN PIIRRETÄÄN VIIVA KAAVA
- at straight angles and implicit H atoms = ÄLÄ KÄYTÄ TÄTÄ
(huom jos nämä eivät toimi (riippuu lisenssistä, versiosta jne), ei hätää... löytyy toinenkin kikka)
Wiew
->stereo ->R/S -> all possible
merkitsee stereosiomeerien ASYMMETRISET HIILET
->stereo ->E/Z
Tämä näyttää E/Z isomerian vastaa cis/trans -isomeriaa ei rengasyhdisteillä
HUOM: Marvin ei tunnista rengasrakenteiden cis/trans -isomeriaa!
->Implicit hydrogens
On Hetero tähän pallukka NÄYTTÄÄ MUIDEN KUIN HIILTEN KANSSA AINA VEDYT
-> Advanced
bond lengths näyttää SIDOSPITUUDET
Lone pairs näyttää VAPAAT ELEKTRONIPARIT
Structure
->Add->Explicit hydrogens
TÄÄLTÄ SAAT TÄYDELLISEEN RAKENNEKAAVAAN VEDYT SIDOSVIIVOJEN KANSSA!
->Remove->Explicit hydrogens
tällä saat vedyt pois... (jos hiilet vielä näkyvät mene edit preferences...)
->generate name TÄLLÄ VOIT NIMETÄ PIIRTÄMÄSI YHDISTEEN englanniksi
voit valita antaako ohjelma nimen IUPAC- vai triviaalimuodossa.
-> name to structure
jos keksit yhdisteen triviaalinimen (tai IUPAC-nimen) englanniksi TÄMÄ PIIRTÄÄ SINULLE NIMEN PERUSTEELLA YHDISTEEN (jos piirsit triviaalinimen perusteella voit sitten katsoa IUPAC-nimen tuolla generate name komennolla)
MOOLIMASSA
MASSASPEKTRI
tästä saat moolimassan yhdisteelle (tarvitaan tehtävätyypissä: Selvitä orgaanisen yhdisteen suhdekaava, molekyylikaava, rakennekaava)
MarvinSpace
ctrl-shift-M (jos MarvinSpace ei oikein toimi, sulje ja avaa uudelleen - oikuttelee välillä)
Huom!
Jos omalle koneellesi lataamassasi Marvinissa ei MarvinSpace toimi, voit ladata sen tästä!
https://chemaxon.com/download?dl=%2Fdata%2Fdownload%2Fmarvinspace%2Flatest
KULMIEN MITTAUSTA
SIDOSTEN PITUUTTA
ELEKTRONITIHEYSPINTA (eli voit arvioida elektronegatiivisuuseroja molekyylissä)
Show -> surface -> van der waals
Display -> color t ype - surface -> electrostatic
Display -> draw type -> transparent
REAKTIOYHTÄLÖT
Orgaaninen kemia:
Kirjoita reagoivat yhdisteet ja laita sopiva reaktionuoli, + tulee automaattisesti.
Jos mielummin haluat tekstieditorilla laittaa + merkin, saat automaatin pois päältä.
Edit->preferences->structure->Automatic plus sign.... pois päältä
Epäorgaaninen kemia:
Helpoin tapa on käyttää abitin matematiikkaeditoria
Abitin editori - täällä voit harjoitella
Kommentit
Kirjaudu sisään lisätäksesi tähän kommentin