MARVIN SKETCH

MITEN MARVININ KANSSA TOIMITAAN

YRITÄ JA EREHDY - SILLÄ TAVALLA OPPII KYLLÄ, mutta näistä ohjeista voi olla apua


MarvinSketch perusohjeita ja harjoituksia (tiedosto)

 

KUN OPETTELET TEKEMÄÄN OIKEAN MUOTOISIA RAKENNEKAAVOJA, kannattaa ensin katsoa videot, mutta sitten jatkossa nopean kertauksen saa diaohjeesta.

Näin saat viivakaavasta sidosviivakaavan ja päinvastoin (video)

Kun haluat sidosviivakaavasta (Kekulé-kaava) Lewis-kaavan, tarvitset kuvaan mukaan vapaat elektroniparit (video)

Tässä linkissä on dioina oikeamuotoisen rakennekaavan ohje.

Yhdisteen nimen etsiminen 

Tässä neuvotaan myös, miten Marvinilla näet moolimassan.

Poolisuutta voi marvinissa kuvata näin:
Calculations -> Charge -> Charge (Display in MarvinSpace)

 

MarvinSketch -kurssi

PIIRTÄMINEN YMS

Edit -> preferences -> structure
general settings
- show lone pair as Line = VIIVANA ruksi tähän, PISTEINÄ ei ruksia tähän
carbon labels
- always = KUN PIIRRETÄÄN TÄYDELLINEN RAKENNE KAAVA
- never = KUN PIIRRETÄÄN VIIVA KAAVA
- at straight angles and implicit H atoms = ÄLÄ KÄYTÄ TÄTÄ

(huom jos nämä eivät toimi (riippuu lisenssistä, versiosta jne), ei hätää... löytyy toinenkin kikka)

Wiew
->stereo ->R/S -> all possible
 
merkitsee stereosiomeerien ASYMMETRISET HIILET 

->stereo ->E/Z
Tämä näyttää E/Z isomerian vastaa cis/trans -isomeriaa ei rengasyhdisteillä
HUOM: Marvin ei tunnista rengasrakenteiden cis/trans -isomeriaa!

->Implicit hydrogens
On Hetero
tähän pallukka NÄYTTÄÄ MUIDEN KUIN HIILTEN KANSSA AINA VEDYT

-> Advanced

bond lengths näyttää SIDOSPITUUDET
Lone pairs näyttää VAPAAT ELEKTRONIPARIT

Structure
->Add->Explicit hydrogens
TÄÄLTÄ SAAT TÄYDELLISEEN RAKENNEKAAVAAN VEDYT SIDOSVIIVOJEN KANSSA!
->Remove->Explicit hydrogens
tällä saat vedyt pois... (jos hiilet vielä näkyvät mene edit preferences...)

->generate name TÄLLÄ VOIT NIMETÄ PIIRTÄMÄSI YHDISTEEN englanniksi
voit valita antaako ohjelma nimen IUPAC- vai triviaalimuodossa.

-> name to structure
jos keksit yhdisteen triviaalinimen (tai IUPAC-nimen) englanniksi TÄMÄ PIIRTÄÄ SINULLE NIMEN PERUSTEELLA YHDISTEEN (jos piirsit triviaalinimen perusteella voit sitten katsoa IUPAC-nimen tuolla generate name komennolla)

Calculations -> Elemental analysis
MOOLIMASSA
MASSASPEKTRI
tästä saat moolimassan yhdisteelle (tarvitaan tehtävätyypissä: Selvitä orgaanisen yhdisteen suhdekaava, molekyylikaava, rakennekaava)  

MarvinSpace 

ctrl-shift-M (jos MarvinSpace ei oikein toimi, sulje ja avaa uudelleen - oikuttelee välillä)

Huom!
Jos omalle koneellesi lataamassasi Marvinissa ei MarvinSpace toimi, voit ladata sen tästä!
https://chemaxon.com/download?dl=%2Fdata%2Fdownload%2Fmarvinspace%2Flatest

 
KULMIEN MITTAUSTA
SIDOSTEN PITUUTTA

ELEKTRONITIHEYSPINTA (eli voit arvioida elektronegatiivisuuseroja molekyylissä)
Show -> surface -> van der waals
Display -> color t ype - surface -> electrostatic
Display -> draw type -> transparent

REAKTIOYHTÄLÖT


Orgaaninen kemia:
Kirjoita reagoivat yhdisteet ja laita sopiva reaktionuoli, + tulee automaattisesti.
Jos mielummin haluat tekstieditorilla laittaa + merkin, saat automaatin pois päältä.
Edit->preferences->structure->Automatic plus sign.... pois päältä

Epäorgaaninen kemia:
Helpoin tapa on käyttää abitin matematiikkaeditoria
Abitin editori - täällä voit harjoitella

Marvin Sketch ohjelman ohjeita, vinkkejä ja harjoituksia

Tältä sivustolta löytyy ratkaisuja Marvinin kanssa operointiin.

Aineistoa ovat tuottaneet useiden eri koulujen opettajat. Siitä heille iso kiitos.

Kaikkiin aineistoihin on ollut tavoitteena laittaa näkyville aineiston tekijän tiedot. Jos tiedot puuttuvat tai aineisto halutaan pois tältä sivustolta, yhteydenotto Eerika.Hakkinen@opedu.kuopio.fi (050-5253335) ja asia hoituu.

OHJEITA

Peda.net käyttää vain välttämättömiä evästeitä istunnon ylläpitämiseen ja anonyymiin tekniseen tilastointiin. Peda.net ei koskaan käytä evästeitä markkinointiin tai kerää yksilöityjä tilastoja. Lisää tietoa evästeistä