Jyväskylän kristillisessä koulussa oppilas voi edetä vuosiluokkiin jaetun oppimäärän sijaan oman opinto-ohjelmansa mukaan (vuosiluokkiin sitomaton opiskelu). Päätös erityisistä opetusjärjestelyistä voidaan tehdä määräaikaisena.

Oppilas luetaan yhdeksännen vuosiluokan oppilaaksi, kunnes hän suorittaa perusopetuksen koko oppimäärän ja saa päättötodistuksen tai hänen oppivelvollisuusikänsä täyttyy ja hän eroaa koulusta.