Musiikkiluokat ovat toimineet Keskuskoulussa 70-luvulta lähtien. Aluksi oppilaat tulivat Haukkavuoren ja Toivo Pekkasen ala-asteilta, myöhemmin Pekkasen koulun musiikkiluokilta. Myös muilta kotkalaisilta peruskoulun 6. luokilta on mahdollista pyrkiä Keskuskoulun musiikkiluokalle.

Musiikkiluokalla opiskelun tavoitteena on oppilaan musiikillisten taitojen ja tietojen ylläpitäminen ja kehittäminen, sekä harrastuneisuuden säilyttäminen ja lisääminen. Pääpaino opinnoissa on omalla soittamisella ja laulamisella, mutta myös musiikin teoria, musiikin kuuntelu ja erilaiset esiintymiset ovat tärkeä osa opiskelua. Aihekokonaisuuksia perusopetuksen 7.-9. musiikinopetuksessa ovat mm. eri maiden ja kulttuurien musiikki, soitinoppi, rock- ja popmusiikin kehitys, näyttämömusiikki, länsimaisen taidemusiikin historia, ajankohtaiset musiikkitapahtumat jne. Erilaiset teemat ja vuodenaikoihin liittyvät juhlat näkyvät myös oppituntien sisällöissä ja esiintymisten ohjelmistoissa.

Tärkeää on positiivisten elämysten ja kokemusten luominen musiikin keinoin ja tekemisen ilon säilyttäminen läpi perusopetuksen.