PIIRTÄMINEN YMS

Edit -> preferences -> structure
general settings
- show lone pair as Line = VIIVANA ruksi tähän, PISTEINÄ ei ruksia tähän
carbon labels
- always = KUN PIIRRETÄÄN TÄYDELLINEN RAKENNE KAAVA
- never = KUN PIIRRETÄÄN VIIVA KAAVA
- at straight angles and implicit H atoms = ÄLÄ KÄYTÄ TÄTÄ

(huom jos nämä eivät toimi (riippuu lisenssistä, versiosta jne), ei hätää... löytyy toinenkin kikka)

Wiew
->stereo ->R/S -> all possible
 merkitsee stereosiomeerien ASYMMETRISET HIILET 

->stereo ->E/Z
Tämä näyttää E/Z isomerian vastaa cis/trans -isomeriaa ei rengasyhdisteillä
HUOM: Marvin ei tunnista rengasrakenteiden cis/trans -isomeriaa!

->Implicit hydrogens
On Hetero tähän pallukka NÄYTTÄÄ MUIDEN KUIN HIILTEN KANSSA AINA VEDYT

-> Advanced
bond lengths näyttää SIDOSPITUUDET
Lone pairs näyttää VAPAAT ELEKTRONIPARIT

Structure
->Add->Explicit hydrogens
TÄÄLTÄ SAAT TÄYDELLISEEN RAKENNEKAAVAAN VEDYT SIDOSVIIVOJEN KANSSA!
->Remove->Explicit hydrogens
tällä saat vedyt pois... (jos hiilet vielä näkyvät mene edit preferences...)

->generate name TÄLLÄ VOIT NIMETÄ PIIRTÄMÄSI YHDISTEEN englanniksi
voit valita antaako ohjelma nimen IUPAC- vai triviaalimuodossa.

-> name to structure
jos keksit yhdisteen triviaalinimen (tai IUPAC-nimen) englanniksi TÄMÄ PIIRTÄÄ SINULLE NIMEN PERUSTEELLA YHDISTEEN (jos piirsit triviaalinimen perusteella voit sitten katsoa IUPAC-nimen tuolla generate name komennolla)

Calculations -> Elemental analysis
MOOLIMASSA
MASSASPEKTRI
tästä saat moolimassan yhdisteelle (tarvitaan tehtävätyypissä: Selvitä orgaanisen yhdisteen suhdekaava, molekyylikaava, rakennekaava)  

MarvinSpace 

ctrl-shift-M (jos MarvinSpace ei oikein toimi, sulje ja avaa uudelleen - oikuttelee välillä)

Huom!
Jos omalle koneellesi lataamassasi Marvinissa ei MarvinSpace toimi, voit ladata sen tästä!
https://chemaxon.com/download?dl=%2Fdata%2Fdownload%2Fmarvinspace%2Flatest

 
KULMIEN MITTAUSTA
SIDOSTEN PITUUTTA

ELEKTRONITIHEYSPINTA (eli voit arvioida elektronegatiivisuuseroja molekyylissä)
Show -> surface -> van der waals
Display -> color t ype - surface -> electrostatic
Display -> draw type -> transparent

REAKTIOYHTÄLÖT

Orgaaninen kemia:
Kirjoita reagoivat yhdisteet ja laita sopiva reaktionuoli, + tulee automaattisesti.
Jos mielummin haluat tekstieditorilla laittaa + merkin, saat automaatin pois päältä.
Edit->preferences->structure->Automatic plus sign.... pois päältä

Epäorgaaninen kemia:
Helpoin tapa on käyttää abitin matematiikkaeditoria
Abitin editori - täällä voit harjoitella