Pallomallilla (kalottimalli) pyritään kuvaamaan kolmiulotteisesti eri atomien suhteellisia kokoja (ja niiden vaatimaa tilaa molekyylissä).
Pallotikkumalli on myös kolmiulotteinen malli, jossa kovalenttisia sidoksia kuvataan tikuilla pallomaisten atomien välissä
Rakennekaava kertoo miten molekyylin atomit ovat sitoutuneet toisiinsa. Sidoksia kuvataan viivoilla ja atomeja niiden kemiallisilla merkeillä.
Molekyylikaava kertoo molekyylin sisältämien atomien lukumäärät, mutta ei mitään sen rakenteesta. Molekyylikaava on lyhyin mahdollinen kuvaus yhdisteestä.
