Puhdas kulta koostuu pelkästään kulta-atomeista, jotka muodostavat hyvin säännöllisen rakenteen. Jos olisi mahdollista katsoa puhtaasta kullasta valmistetun kultasormuksen sisään, niin nähtäisiin joka suuntaan jatkuvia kulta-atomeista muodostuneita rivistöjä. Kullan rakenneosia ovat siis yksittäiset kulta-atomit.





Puhtaan vedyn rakenne on erilainen. Sen rakenneosia ovat vetymolekyylit. Vetymolekyyli koostuu kahdesta vetyatomista, jotka ovat liittyneet toisiinsa kemiallisen sidoksen avulla.

Myös puhtaan hapen ja typen rakenneosat ovat molekyylejä. Typpimolekyyli koostuu kahdesta typpiatomista, mutta hapen rakenneosana voi olla joko kahden happiatomin muodostama happimolekyyli tai kolmen happiatomin muodostama otsonimolekyyli.

Molekyylien nimien lisäksi kemiassa käytetään usein pelkkiä kemiallisia merkkejä. Ensin kirjoitetaan kyseisen alkuaineen kemiallinen merkki ja sen jälkeen oikeaan alakulmaan molekyylissä esiintyvien atomien lukumäärä. Vetymolekyylin merkintä H₂ kertoo, että se koostuu kahdesta vetyatomista. Jos näitä vetymolekyylejä on useampia, niin niiden lukumäärä merkitään molekyylin merkinnän eteen. Esimerkiksi kolme vetymolekyyliä merkitään 3 H₂, yksi happimolekyyli merkitään O₂ ja kaksi otsonimolekyyliä 2 O₃.