Alkuaine (element) koostuu vain yhdenlaisista atomeista. Alkuaineen kaikilla atomeilla on sama järjestysluku, Z, eli niiden ytimessä on sama määrä protoneja.

Allotropia (allotropy) on alkuaineiden kyky esiintyä samassa paineessa ja lämpötilassa erilaisissa kemiallisissa muodoissa.

Amorfisen aineen (amorphous solid) rakenneyksiköillä ei ole säännöllistä rakennetta.

Anioni (anion) on ioni, jolla on negatiivinen sähkövaraus.

Aromaattinen yhdiste (aromatic compound) on orgaaninen yhdiste, joka sisältää bentseenirenkaan.

Asymmetrinen hiiliatomi (asymmetric carbon atom) on hiiliatomi, johon on liittynyt neljä erilaista atomia tai atomiryhmää.

Atomiorbitaali (atomic orbital) on atomin ytimen läheisyydessä sijaitseva avaruuden osa, josta elektroni todennäköisesti löytyy. Atomiorbitaaleja ovat esim. s-, p-, d- ja f-orbitaalit.