Nuolien käyttö
Reaktioyhtälön piirtäminen
MarvinSketch-ohjelma mahdollistaa reaktioyhtälöiden piirtämisen mahdollistaen erilaiset nuoret (myös reaktiomekanismien kuvaamiseen tarkoitettuja) ja automaattiset plus-merkit. Plus-merkkiautomatiikan käytöllä on rajoituksensa. Se toimii käytännössä vain yhden reaktion kuvaamisessa.
Kuva 1: Esteröitymisreaktio
Jos ja kun ollaan tarkkoja siinä, että kyse on tasapainoreaktiosta, käytetään toisenlaista reaktionuolta. Valitaan reaktionuoli ja vasemman reunan valikosta valitaan nuoli-ikoni ja vaihdetaan yksisuuntainen reaktionuoli kaksisuuntaiseksi.
Kuvat 2-3: Esteröitymisreaktion nuolen vaihtaminen
Reaktiomekanismin piirtämiseen käytetään kaarinuolta.
Kuva 4-5: Reaktiomekanismin kuvaamista kaartinnuolella
Reaktiomekanismin kuvaamisessa käytetään usein myös selittäviä merkintöjä, kuten esimerkiksi osittaisvarauksia. Alla olevassa kuvassa osittaisvarauksen piirtämiseen on käytetty tekstityökalua ja valittu symboleista sopiva kreikkalainen kirjain.
Kuva 6. Osittaisvarauksen piirtäminen
Kuva 1: Esteröitymisreaktio
Jos ja kun ollaan tarkkoja siinä, että kyse on tasapainoreaktiosta, käytetään toisenlaista reaktionuolta. Valitaan reaktionuoli ja vasemman reunan valikosta valitaan nuoli-ikoni ja vaihdetaan yksisuuntainen reaktionuoli kaksisuuntaiseksi.
Kuvat 2-3: Esteröitymisreaktion nuolen vaihtaminen
Reaktiomekanismin piirtämiseen käytetään kaarinuolta.
Kuva 4-5: Reaktiomekanismin kuvaamista kaartinnuolella
Reaktiomekanismin kuvaamisessa käytetään usein myös selittäviä merkintöjä, kuten esimerkiksi osittaisvarauksia. Alla olevassa kuvassa osittaisvarauksen piirtämiseen on käytetty tekstityökalua ja valittu symboleista sopiva kreikkalainen kirjain.
Kuva 6. Osittaisvarauksen piirtäminen
Liitteet:
Koordinaatiosidokset nuolena
Koordinaatiosidoksien kuvaaminen nuolella on monella tapaa mielekästä. Se kertoo siitä, että kyse on juuri koordinaatiosidoksesta (ei tavallisesti kovalenttisesta sidoksesta) ja miltä atomilta koordinaatiosidoksen elektronipari tulee. Kohdassa "Coordinate" Bond Line Style voidaan valita joko nuoli tai tavallinen viiva sidosta osoittamaan.