2. Rakennekaavojen piirtäminen

Rakenteiden piirtäminen

  1. Valitse ensin lisättävä atomi tai atomiryhmä sekä sidostyyppi.
  2. Lisää ensin yksi rakenne työpöydälle.
  3. Lisää seuraava rakenne klikkaammalla uusi rakenne päädyssä sijaitsevaan atomiryhmään.
piirto.png

Ominaisuuksien muokkaaminen

Seuraavaksi tutustutaan, miten rakenteiden ominaisuuksia voidaan muuttaa. Huomaat varmaan, että ChemSketch piirtää oletuksena hiiliketjun hiilet viivakaavana. Entä jos haluaisit hiilen symbolin näkyviin. Se saadaan näkyviin muuttamalla rakenteen tyylillisiä ominaisuuksia Tools > Structure Properties -valikosta.

Muokkaaminen edellyttää valitsemista. Rakenne valitaan ensin lassolla, jonka jälkeen Structure properties -ikkunasta valitaan tarvittavat valinnat. Lopuksi valinnat siirretään työstettävään rakenteeseen Apply-komennolla.

ominaisuudet.png
Huomaa, että vedyt voit poistaa suoraan Tools-valikosta.

Nimeäminen ja tiedonhaku

Nimeäminen

ChemSketchissä rakenteiden nimeäminen on helppoa. Valitse Tools > Generate > Name for Structure, jolloin työpöydälle ilmestyy yhdisteen nimi englanniksi.
nimeäminen.png

Tiedonhaku

ChemSketch tarjoaa erinomaisia tietorajapintoja. Valitse rakenne josta haluat lisätietoa, ja klikkaa tarvitsemaasi tietorajapintaa. Haettava tieto voidaan tulostaa uuteen ikkunaan ChemSketchin sisälle tai selainikkunaan.

tiedonhaku.png

Tallentaminen eri muodoissa

ChemSkethissä tallennus tehdään valikosta File > Save tai Save as. ChemSketchin oletustallennusformaatti on .sk2. Siinä muodossa tallennettu työ voidaan avata myöhemmin uudestaan ChemSkethissä.

Save as -valinta tarjoaa lisäksi ison kasan muita tiedostotyyppejä, kuten esimerkiksi .mol-tiedoston. Molekyyli (.mol) -tiedosto tallentaa molekyylipiirroksen 3D-mallina, joka voidaan avata 3D-ohjelmistoissa (esim. Jmolissa tai Avogadro).

Tallennusvalikon alaosassa on vielä muutama kuvatiedosto (.tif, .gif tai .png).

tallennus.png