Puupuhaltimista suurin on fagotti. Se on myös matalaäänisin. Aluksi fagotit rakennettiin yhdestä puukappaleesta. Fagotin läppäkoneiston kehitys on ollut hyvin samanlainen kuin muidenkin puupuhaltimien. Sävellettävän ja esitettävän musiikin vaatimusten lisääntyessä myös läppien määrää on täytynyt lisätä. Fagotissa on myös oboen tapaan kaksoislehdykkä.

Kaksoislehdykän tekee tai ainakin viimeistelee yleensä soittaja itse. Se valmistetaan hyvin huolellisesti. Lehdykän onnistuminen on hyvin tärkeää soittamisen ja äänen kannalta!

Ludvig XIV:n hovissa toimineessa oboeyhtyeessä Kuninkaan kaksitoista suurta oboistia oli todellisuudessa myös fagotisteja. Fagotin tärkeäksi kehittäjäksi myös nimetään jo oboen kohdalla mainittu Jean Hotteterre.

Fagotin putki on pitkä, mutta kontrafagotin eli matalaäänisen fagotin putki vasta pitkä onkin! Se on liki kuusimetrinen. Näin pitkää soitinta olisi hyvin vaikea käsitellä, joten putki on tietenkin taivuteltu mutkalle. Soitin on silti melkoisen iso!