Sosiaali- ja terveysministeriöllä (STM) on STUKin hallinnoima valtion pienjätevarasto, jonne on sijoitettu käytöstä poistettuja säteilylähteitä, joille ei ole löydetty mitään muuta sijoitusvaihtoehtoa. Tällaisia ovat lähteet, joita ei voi palauttaa maahantuojalle tai valmistajalle tai joita mikään muukaan toimija ei halua vastaanottaa. Myös niin sanotut orvot säteilylähteet, joiden alkuperä on tuntematon, päätyvät valtion pienjätevarastoon. Niitä tulee yleisimmin vastaan jäteasemilla tai virheellisinä toimituksina.

Suomessa on myös maailman ensimmäinen käytetyn ydinpolttoaineen geologinen loppusijoitusluola Posiva Onkalo Eurajoella. Onkalon rakentaminen on aloitettu vuonna 2004, ja siellä on siitä asti tutkittu maaperän sopivuutta geologiseen loppusijoitukseen. Kapselointilaitoksen rakentaminen aloitettiin vuonna 2019. Posivan Onkalon myötä Suomi on ainoa maa, jolla tulee olemaan jo tällä vuosikymmenellä kestävä ratkaisu ydinjätteestä huolehtimiseen.

Teollisuudesta, tutkimuksesta ja sairaalatoiminnasta syntyvä ja loppusijoitettava radioaktiivinen jäte sekoitetaan usein ydinvoimalaitoksen korkea-aktiivisen ydinjätteen loppusijoitukseen.

Ydinvoimaloista syntyy myös matala- ja keskiaktiivista radioaktiivista jätettä, muun muassa henkilöstön suojavaatetuksesta, laitteiden suodattimista ja käytöstä poistettavista laitteista.