Jyväskylän kristillisessä koulussa on tarjolla monipuolinen valinnaiskurssitarjotin, josta jokainen oppilas voi valita itselleen mielekkäät vaihtoehdot valinnaisista kursseista. Tarjolla on monipuolisesti taide- ja taitoaineiden valinnaisia kursseja kuin muitakin valinnaisia kursseja. Valinnaisaineiden tarjonnasta toteutetaan vuosittain ne kurssit, joita valitaan riittävästi. Valinnaiskurssien tarjontaa tarkennetaan vuosittain lukuvuosisuunnitelmassa ja/tai valinnaisaineoppaassa. Taito- ja taideaineiden valintaa ohjataan kurssitarjonnassa siten, että viisi vuosiviikkotuntia tulee valituksi näissä aineissa luokilla 8-9.

Vapaasti valittavat aineet
Valinnaisten aineiden tehtävänä on syventää ja laajentaa oppilaan osaamista oppilaan valinnan mukaisesti. Valinnaisten aineiden yhteenlaskettu määrä on koulussamme kymmenen vuosiviikkotuntia. Tunnit on sijoitettu vuosiluokille 8–9.

Valinnaisena aineena tarjotaan perusopetuksen yhteisten aineiden syventäviä ja soveltavia opintoja. Syventävät valinnaiset aineet syventävät ja/tai laajentavat yhteisten oppiaineiden tavoitteita ja sisältöjä. Soveltavat valinnaiset aineet sisältävät aineksia useasta eri oppiaineesta tai laaja-alaisesta osaamisesta ja edistävät oppiaineiden yhteistyötä.

Lukuvuositodistuksessa ne valinnaiset aineet, jotka muodostavat yhtenäisen, vähintään kahden vuosiviikkotunnin oppimäärän, arvioidaan numeroin. Oppimäärältään alle kaksi vuosiviikkotuntia käsittävät valinnaiset aineet ja tällaisista oppimääristä koostuvat kokonaisuudet arvioidaan sanallisesti. Mikäli sanallisesti tai numerolla arvioitu valinnainen aine katsotaan jonkin yhteisen aineen syventäviksi opinnoiksi, sen suoritus voi korottaa kyseisen oppiaineen päättöarvosanaa. Sanallisesti arvioidut valinnaiset arvioidaan asteikolla hyväksytty -hylätty.  hyväksytty - kiitettävästi hyväksytty.

Koulun valinnaiset aineet esitellään vuosittain tarkastettavassa valinnaisaineoppaassa.

Valinnainen uskonto
Uskonto on koulun painotusaine. Uskonnon oppimäärää syvennetään luokilla 3-6 ja luokilla 8-9. Valinnainen uskonto painottuu koulun maailmankatsomuksen mukaan kristinuskon sisältöihin. Valinnaista uskontoa ei arvioida erikseen. Käytännössä valinnainen uskonto on koulun luokkarajat ylittävää toimintaa aamupiirinä, jossa oppilaat viikottain kokoontuvat yhteisten asioiden äärelle. Tätä esitellään tarkemmin luvussa 11.2.1.