Lypellä on kolme laaja-alaista erityisopettajaa, jotka työskentelevät yleisopetuksen oppilaiden kanssa.
Kts. osa-aikainen erityisopetus. 

Koulussamme on kolme pienluokkaa, jotka työskentelevät erityisopettajien johdolla. 
Kt.s pienluokat. 

Lisäksi Lypellä on yksi Joensuun kaupungin keskitetyistä emo-pienryhmistä, johon haku tapahtuu erillisellä hakulomakkeella.