MarvinSketch-ohjelma mahdollistaa reaktioyhtälöiden piirtämisen mahdollistaen erilaiset nuoret (myös reaktiomekanismien kuvaamiseen tarkoitettuja) ja automaattiset plus-merkit. Plus-merkkiautomatiikan käytöllä on rajoituksensa. Se toimii käytännössä vain yhden reaktion kuvaamisessa. 

Kuva 1: Esteröitymisreaktio 


Jos ja kun ollaan tarkkoja siinä, että kyse on tasapainoreaktiosta, käytetään toisenlaista reaktionuolta. Valitaan reaktionuoli ja vasemman reunan valikosta valitaan nuoli-ikoni ja vaihdetaan yksisuuntainen reaktionuoli kaksisuuntaiseksi.

Kuvat 2-3: Esteröitymisreaktion nuolen vaihtaminen



Reaktiomekanismin piirtämiseen käytetään kaarinuolta.

Kuva 4-5: Reaktiomekanismin kuvaamista kaartinnuolella



Reaktiomekanismin kuvaamisessa käytetään usein myös selittäviä merkintöjä, kuten esimerkiksi osittaisvarauksia. Alla olevassa kuvassa osittaisvarauksen piirtämiseen on käytetty tekstityökalua ja valittu symboleista sopiva kreikkalainen kirjain.

Kuva 6. Osittaisvarauksen piirtäminen

Kuva 7: Tekstityökalun käyttö esim. osittaisvarauksen piirtämiseen.

Tekstityökalun valinta avaa työpöydän alareunaan editorin, josta voi valita fontin lisäksi alaindeksin tai yläindeksi sekä symbolin. Symboli ilmestyy tekstikenttään, kun seuraava kirjain tai merkki (osittaisvarauksen vapauksessa + tai -) lisätään tekstiin. Muuttaminen ylä- tai alaindeksiksi tapahtuu valitsemalla ko. merkki ja klikkaamalla alareunan valikon oikeaa kohtaa.  Kuva 8. Symbolien piirtäminen