Pienestä koostaan huolimatta, monet selkärangattomat ovat petoja. Pedot syövät kasveja syöviä selkärangattomia ja pitävät niiden määrän kurissa. Erityisesti muurahaiset ja hämähäkit ovat metsäekosysteemille tärkeitä, koska ne syövät tuhohyönteisiä. 

Metsän pohjalla ja maaperässä elää kaksoisjalkaisia, maasiiroja, etanoita, kotiloita, änkyri- ja kastematoja. Nämä maaperässä elävät selkärangattomat hankkivat ravintonsa hajottamalla kuolleita eläimiä ja kasvien osia sekä eläinten  jätöksiä. Sienten ohella ne siis toimivat metsässä hajottajina, jotka palauttavat ravinteita takaisin kasvien käyttöön.