Hyvinvointiopetuksen tavoitteet sisältyvät vahvasti 9.lk oppiaineissa terveystiedon ja oppilaanohjaukset sisältöihin.

Terveystiedon tavoitteet T1, T2, T3, T4, T5, T6, T7 linkittyvät hyvinvointiopetuksen tavoitteisiin. Ne sisältävät aiheita myös hyvinvointiopetuksen aihepiireistä.Terveystiedon tunnilla hyvinvointiopetuksen osa-alueilla painottuvat HyTe-kärjistä hyvinvoinnin tukemisen näkökulma. Hyvinvointiopetuksen näkökulmia (HyTe-kärjet) sisällöissä ovat terveyden edistäminen (mielen hyvinvointi, terveelliset elintavat), itsetuntemus (mielen hyvinvointi), tunne- ja vuorovaikutustaidot (osallisuus ja yhteisöllisyys, mielen hyvinvointi), terveelliset elintavat (terveelliset elintavat) ja hyvinvointia tukeva vapaa-aika (arjen turvallisuus, terveelliset elintavat).

Oppilaanohjauksen teemoista osa on myös hyvinvointituntien sisältöjä. Oppilaanohjauksen tehtävänä on tukea oppilaan kasvua ja kehitystä siten, että oppilas kykenee edistämään opiskelu- ja sosiaalisia taitojaan sekä kehittämään elämänhallinnan taitoja.

Oppilaanohjauksen avulla edistetään oikeudenmukaisuuden, yhdenvertaisuuden, tasa-arvon ja osallisuuden toteutumista sekä ehkäistään syrjäytymistä koulutuksesta. Oppilaanohjauksessa käsiteltäviä aiheita hyvinvointituntien aihealueista ovat opiskelutaidot ja koulunkäynti sekä itsetuntemus.