Pakollisten ja valtakunnallisesti tarjottavien syventävien kurssien lisäksi Perhon lukiossa on tarjolla soveltavia kursseja. Kaikkia kursseja ei välttämättä ole tarjolla joka lukuvuonna. 

Kursseista ENA1/09v suoritetaan ennen kurssia ENA1/01, kurssi ENA1/13v on puolestaan suunnattu abiturienteille.