Haapajärven lukiossa tarjotaan valtakunnallisen opetussuunnitelman mukainen fysiikan pakollinen moduuli FY1 yhdistettynä kemian moduuliin KE1 yhteensä kahden opintopisteen laajuisena opintojaksona ja fysiikan pakollinen moduuli FY2 yhdistettynä kemian moduuliin KE2 myöskin kahden opintopisteen laajuisena opintojaksona.