Lukion toimintaa ohjaavat lukiolaki ja –asetus, valtioneuvoston asetus valtakunnallisista tavoitteista ja lukiokoulutuksen tuntijaosta sekä Opetushallituksen laatimat opetussuunnitelman perusteet.

Opetussuunnitelma on koulutyön kehittämisen, toteuttamisen ja arvioinnin väline. Yhteislyseon aikuisopetuksella on oma opetussuunnitelmansa.

Koska Forssan yhteislyseo on kaupungin ainoa lukio, FYL:n opetussuunnitelma on samalla koko kaupungin lukio-opetuksen opetussuunnitelma. Johtokunta hyväksyy opetussuunnitelmaan perustuvan lukuvuosisuunnitelman. Siinä asetetaan lukion toiminnalle lukuvuosikohtaiset tavoitteet ja toteuttamissuunnitelmat.  

Johtokunta on hyväksynyt lukion järjestyssäännöt.