Naakan koulussa pidetään tärkeänä, että oppilaista kasvaa aktiivisia ja vastuullisia kansalaisia. Kasvua tuetaan ottamalla oppilaat mukaan toiminnan suunnitteluun. Keskeisiä keinoja osallistamisessa ovat oppilaskunta- ja tukioppilastoiminta. Oppilailla on pysyväisedustus koulun ruokalatoimikunnassa sekä NYKKY ry:ssä (Naakan koti ja koulu –yhdistys).

Naakan koulussa toteutetaan opetussuunnitelmaa yhteistyössä paikallisten toimijoiden kanssa, mm. seurakunnan, nuorisotoimen ja urheiluseurojen kanssa. Toiminta on suunnitelmallista ja siinä pyritään läpinäkyvyyteen.