• Molekyyliyhdisteet muodostuvat yleensä vain epämetalliatomeista.
  • esim. H₂O, CO₂

• Molekyyliyhdisteissä atomien välillä on kovalenttinen sidos. 

• Atomit saavat uloimmalle energiatasolle oktetin käyttämällä yhteisiä elektroneja. 

Esim. Vesi H₂O on molekyyliyhdiste. 

• Molekyyliyhdisteen nimetään muuten kuten ioniyhdiste, mutta atomien määrä kerrotaan nimessä etuliitteellä ennen kyseisen atomin nimeä.

1	mono-
2	di-
3	tri-
4	tetra-
5	penta-

Esim. CO hiilimonoksidi, CO₂ hiilidioksidi, H₂O divetyoksidi