Detective Pikachu alkaa sillä, että Tim Goodmanin isä on tiettävästi kuollut, mutta pian Harryn (isän) kumppani Pikachu tapaa Timin, ja he alkavat etsiä Timin isää, koska Pikachu tuntee "hyytelöissään", että tämä on elossa. He alkavat etsiä Ryme Citystä, ja löytävät aloittelevan reportterin, joka auttaa heitä etsinnöissä... loppua en paljasta ;)